Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNIP1Q15025 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNIP1Q15025 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNIP1Q15025 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNIP1Q15025 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNIP1Q15025 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNIP1Q15025 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNIP1Q15025 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNIP1Q15025 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNIP1Q15025 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNIP1Q15025 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNIP1Q15025 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNIP1Q15025 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNIP1Q15025 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNIP1Q15025 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TNIP1Q15025 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNIP1Q15025 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNIP1Q15025 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TNIP1Q15025 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNIP1Q15025 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNIP1Q15025 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNIP1Q15025 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TNIP1Q15025 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNIP1Q15025 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TNIP1Q15025 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TNIP1Q15025 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNIP1Q15025 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNIP1Q15025 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNIP1Q15025 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNIP1Q15025 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNIP1Q15025 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
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