Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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