Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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