Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms