Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms