Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms