Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms