Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RELAQ04206 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RELAQ04206 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RELAQ04206 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RELAQ04206 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RELAQ04206 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RELAQ04206 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RELAQ04206 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RELAQ04206 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RELAQ04206 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RELAQ04206 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RELAQ04206 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RELAQ04206 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RELAQ04206 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RELAQ04206 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RELAQ04206 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RELAQ04206 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RELAQ04206 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RELAQ04206 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RELAQ04206 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RELAQ04206 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RELAQ04206 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RELAQ04206 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RELAQ04206 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RELAQ04206 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RELAQ04206 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RELAQ04206 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RELAQ04206 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RELAQ04206 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RELAQ04206 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELAQ04206 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELAQ04206 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RELAQ04206 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELAQ04206 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELAQ04206 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELAQ04206 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELAQ04206 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELAQ04206 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELAQ04206 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELAQ04206 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELAQ04206 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELAQ04206 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELAQ04206 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELAQ04206 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELAQ04206 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELAQ04206 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELAQ04206 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RELAQ04206 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELAQ04206 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELAQ04206 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RELAQ04206 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RELAQ04206 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELAQ04206 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELAQ04206 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RELAQ04206 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELAQ04206 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELAQ04206 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELAQ04206 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELAQ04206 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELAQ04206 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELAQ04206 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELAQ04206 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELAQ04206 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELAQ04206 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELAQ04206 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELAQ04206 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RELAQ04206 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RELAQ04206 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RELAQ04206 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RELAQ04206 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RELAQ04206 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RELAQ04206 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RELAQ04206 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RELAQ04206 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RELAQ04206 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RELAQ04206 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RELAQ04206 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RELAQ04206 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RELAQ04206 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RELAQ04206 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RELAQ04206 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RELAQ04206 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RELAQ04206 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RELAQ04206 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RELAQ04206 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RELAQ04206 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RELAQ04206 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RELAQ04206 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RELAQ04206 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
RELAQ04206 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RELAQ04206 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RELAQ04206 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RELAQ04206 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RELAQ04206 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RELAQ04206 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RELAQ04206 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RELAQ04206 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RELAQ04206 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RELAQ04206 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RELAQ04206 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms