Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ID3Q02535 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
ID3Q02535 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ID3Q02535 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ID3Q02535 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ID3Q02535 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ID3Q02535 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ID3Q02535 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ID3Q02535 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ID3Q02535 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ID3Q02535 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ID3Q02535 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ID3Q02535 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ID3Q02535 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ID3Q02535 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ID3Q02535 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ID3Q02535 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ID3Q02535 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ID3Q02535 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ID3Q02535 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ID3Q02535 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ID3Q02535 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ID3Q02535 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ID3Q02535 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ID3Q02535 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ID3Q02535 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ID3Q02535 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ID3Q02535 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ID3Q02535 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ID3Q02535 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ID3Q02535 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ID3Q02535 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ID3Q02535 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ID3Q02535 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ID3Q02535 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ID3Q02535 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ID3Q02535 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ID3Q02535 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ID3Q02535 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ID3Q02535 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ID3Q02535 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ID3Q02535 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ID3Q02535 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ID3Q02535 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ID3Q02535 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ID3Q02535 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ID3Q02535 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ID3Q02535 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ID3Q02535 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ID3Q02535 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ID3Q02535 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ID3Q02535 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ID3Q02535 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ID3Q02535 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ID3Q02535 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ID3Q02535 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ID3Q02535 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ID3Q02535 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ID3Q02535 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ID3Q02535 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ID3Q02535 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ID3Q02535 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ID3Q02535 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ID3Q02535 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ID3Q02535 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ID3Q02535 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ID3Q02535 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ID3Q02535 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ID3Q02535 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ID3Q02535 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ID3Q02535 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ID3Q02535 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ID3Q02535 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ID3Q02535 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ID3Q02535 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ID3Q02535 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ID3Q02535 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ID3Q02535 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ID3Q02535 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ID3Q02535 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ID3Q02535 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ID3Q02535 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ID3Q02535 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ID3Q02535 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ID3Q02535 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ID3Q02535 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ID3Q02535 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ID3Q02535 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ID3Q02535 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ID3Q02535 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ID3Q02535 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ID3Q02535 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ID3Q02535 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ID3Q02535 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ID3Q02535 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ID3Q02535 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ID3Q02535 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ID3Q02535 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ID3Q02535 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ID3Q02535 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms