Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms