Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms