Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASIC1P78348 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms