Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms