Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THOP1P52888 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THOP1P52888 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THOP1P52888 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THOP1P52888 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THOP1P52888 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THOP1P52888 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THOP1P52888 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THOP1P52888 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THOP1P52888 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THOP1P52888 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THOP1P52888 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THOP1P52888 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THOP1P52888 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
THOP1P52888 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THOP1P52888 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THOP1P52888 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THOP1P52888 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
THOP1P52888 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THOP1P52888 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THOP1P52888 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
THOP1P52888 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
THOP1P52888 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THOP1P52888 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THOP1P52888 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THOP1P52888 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
THOP1P52888 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
THOP1P52888 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
THOP1P52888 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THOP1P52888 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THOP1P52888 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THOP1P52888 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
THOP1P52888 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
THOP1P52888 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
THOP1P52888 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THOP1P52888 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
THOP1P52888 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
THOP1P52888 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
THOP1P52888 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
THOP1P52888 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
THOP1P52888 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
THOP1P52888 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
THOP1P52888 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
THOP1P52888 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
THOP1P52888 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THOP1P52888 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THOP1P52888 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
THOP1P52888 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THOP1P52888 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THOP1P52888 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THOP1P52888 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THOP1P52888 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THOP1P52888 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
THOP1P52888 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THOP1P52888 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
THOP1P52888 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
THOP1P52888 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
THOP1P52888 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
THOP1P52888 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
THOP1P52888 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
THOP1P52888 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
THOP1P52888 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
THOP1P52888 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
THOP1P52888 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
THOP1P52888 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
THOP1P52888 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
THOP1P52888 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
THOP1P52888 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
THOP1P52888 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
THOP1P52888 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
THOP1P52888 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
THOP1P52888 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
THOP1P52888 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
THOP1P52888 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
THOP1P52888 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
THOP1P52888 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
THOP1P52888 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
THOP1P52888 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
THOP1P52888 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
THOP1P52888 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
THOP1P52888 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
THOP1P52888 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
THOP1P52888 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
THOP1P52888 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
THOP1P52888 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
THOP1P52888 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
THOP1P52888 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
THOP1P52888 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
THOP1P52888 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
THOP1P52888 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
THOP1P52888 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
THOP1P52888 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
THOP1P52888 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
THOP1P52888 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
THOP1P52888 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
THOP1P52888 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
THOP1P52888 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
THOP1P52888 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
THOP1P52888 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
THOP1P52888 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms