Protein–RNA interactions for Protein: P49023

PXN, Paxillin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXNP49023 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PXNP49023 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PXNP49023 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PXNP49023 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PXNP49023 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PXNP49023 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PXNP49023 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PXNP49023 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PXNP49023 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PXNP49023 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PXNP49023 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PXNP49023 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PXNP49023 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PXNP49023 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PXNP49023 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PXNP49023 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PXNP49023 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PXNP49023 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PXNP49023 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PXNP49023 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PXNP49023 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PXNP49023 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PXNP49023 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PXNP49023 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PXNP49023 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PXNP49023 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PXNP49023 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PXNP49023 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PXNP49023 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PXNP49023 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PXNP49023 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PXNP49023 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PXNP49023 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PXNP49023 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PXNP49023 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PXNP49023 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PXNP49023 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PXNP49023 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PXNP49023 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PXNP49023 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PXNP49023 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PXNP49023 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PXNP49023 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PXNP49023 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PXNP49023 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PXNP49023 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PXNP49023 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PXNP49023 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PXNP49023 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PXNP49023 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PXNP49023 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PXNP49023 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PXNP49023 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PXNP49023 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PXNP49023 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PXNP49023 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PXNP49023 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PXNP49023 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PXNP49023 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PXNP49023 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PXNP49023 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PXNP49023 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PXNP49023 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PXNP49023 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PXNP49023 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PXNP49023 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PXNP49023 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PXNP49023 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PXNP49023 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PXNP49023 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PXNP49023 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PXNP49023 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PXNP49023 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PXNP49023 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PXNP49023 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PXNP49023 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PXNP49023 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PXNP49023 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PXNP49023 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PXNP49023 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PXNP49023 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PXNP49023 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PXNP49023 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PXNP49023 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PXNP49023 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PXNP49023 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PXNP49023 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PXNP49023 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PXNP49023 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PXNP49023 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PXNP49023 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PXNP49023 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PXNP49023 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PXNP49023 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PXNP49023 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PXNP49023 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PXNP49023 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PXNP49023 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PXNP49023 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PXNP49023 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms