Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms