Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms