Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms