Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DESP17661 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DESP17661 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DESP17661 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DESP17661 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DESP17661 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DESP17661 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DESP17661 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DESP17661 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DESP17661 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DESP17661 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DESP17661 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DESP17661 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DESP17661 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DESP17661 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DESP17661 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DESP17661 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DESP17661 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DESP17661 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DESP17661 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DESP17661 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DESP17661 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DESP17661 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DESP17661 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DESP17661 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DESP17661 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DESP17661 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DESP17661 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DESP17661 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DESP17661 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DESP17661 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DESP17661 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DESP17661 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DESP17661 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DESP17661 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DESP17661 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DESP17661 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DESP17661 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DESP17661 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DESP17661 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DESP17661 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DESP17661 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DESP17661 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DESP17661 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DESP17661 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DESP17661 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DESP17661 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DESP17661 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DESP17661 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DESP17661 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DESP17661 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DESP17661 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DESP17661 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DESP17661 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DESP17661 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DESP17661 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DESP17661 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DESP17661 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DESP17661 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DESP17661 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DESP17661 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DESP17661 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DESP17661 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DESP17661 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DESP17661 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DESP17661 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DESP17661 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DESP17661 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DESP17661 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DESP17661 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DESP17661 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DESP17661 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DESP17661 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DESP17661 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DESP17661 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DESP17661 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DESP17661 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DESP17661 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DESP17661 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DESP17661 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DESP17661 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DESP17661 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DESP17661 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DESP17661 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DESP17661 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DESP17661 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DESP17661 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DESP17661 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DESP17661 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DESP17661 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DESP17661 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DESP17661 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DESP17661 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DESP17661 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DESP17661 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DESP17661 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DESP17661 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DESP17661 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DESP17661 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DESP17661 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.8 ms