Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CTLA4P16410 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms