Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms