Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00032P0C843 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00032P0C843 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00032P0C843 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00032P0C843 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00032P0C843 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00032P0C843 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00032P0C843 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00032P0C843 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00032P0C843 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC00032P0C843 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC00032P0C843 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00032P0C843 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC00032P0C843 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00032P0C843 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00032P0C843 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC00032P0C843 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00032P0C843 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00032P0C843 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00032P0C843 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00032P0C843 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00032P0C843 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00032P0C843 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00032P0C843 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC00032P0C843 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC00032P0C843 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00032P0C843 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00032P0C843 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00032P0C843 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00032P0C843 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00032P0C843 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00032P0C843 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00032P0C843 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00032P0C843 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00032P0C843 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00032P0C843 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00032P0C843 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00032P0C843 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00032P0C843 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00032P0C843 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00032P0C843 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00032P0C843 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00032P0C843 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00032P0C843 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LINC00032P0C843 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00032P0C843 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00032P0C843 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00032P0C843 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00032P0C843 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00032P0C843 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00032P0C843 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00032P0C843 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00032P0C843 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00032P0C843 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00032P0C843 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LINC00032P0C843 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00032P0C843 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00032P0C843 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00032P0C843 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00032P0C843 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LINC00032P0C843 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00032P0C843 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00032P0C843 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00032P0C843 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00032P0C843 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00032P0C843 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00032P0C843 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LINC00032P0C843 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00032P0C843 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00032P0C843 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00032P0C843 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00032P0C843 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00032P0C843 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00032P0C843 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00032P0C843 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LINC00032P0C843 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00032P0C843 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00032P0C843 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00032P0C843 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00032P0C843 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00032P0C843 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00032P0C843 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00032P0C843 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00032P0C843 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00032P0C843 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00032P0C843 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00032P0C843 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00032P0C843 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00032P0C843 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00032P0C843 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms