Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA4P06727 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA4P06727 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA4P06727 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA4P06727 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA4P06727 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA4P06727 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA4P06727 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA4P06727 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA4P06727 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA4P06727 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA4P06727 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA4P06727 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA4P06727 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA4P06727 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA4P06727 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA4P06727 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA4P06727 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA4P06727 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA4P06727 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA4P06727 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA4P06727 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA4P06727 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA4P06727 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA4P06727 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA4P06727 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA4P06727 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA4P06727 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA4P06727 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA4P06727 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA4P06727 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA4P06727 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA4P06727 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA4P06727 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA4P06727 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA4P06727 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA4P06727 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA4P06727 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA4P06727 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA4P06727 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA4P06727 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA4P06727 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA4P06727 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA4P06727 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA4P06727 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA4P06727 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA4P06727 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA4P06727 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA4P06727 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA4P06727 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
APOA4P06727 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOA4P06727 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOA4P06727 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOA4P06727 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOA4P06727 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOA4P06727 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOA4P06727 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOA4P06727 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOA4P06727 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOA4P06727 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
APOA4P06727 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOA4P06727 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOA4P06727 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA4P06727 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA4P06727 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA4P06727 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA4P06727 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA4P06727 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA4P06727 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA4P06727 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA4P06727 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA4P06727 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA4P06727 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA4P06727 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA4P06727 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA4P06727 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA4P06727 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA4P06727 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA4P06727 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA4P06727 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA4P06727 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA4P06727 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA4P06727 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA4P06727 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA4P06727 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA4P06727 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA4P06727 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA4P06727 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA4P06727 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA4P06727 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA4P06727 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA4P06727 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA4P06727 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA4P06727 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA4P06727 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA4P06727 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA4P06727 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA4P06727 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOA4P06727 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOA4P06727 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms