Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTMAP06454 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTMAP06454 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTMAP06454 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTMAP06454 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PTMAP06454 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTMAP06454 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTMAP06454 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTMAP06454 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTMAP06454 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTMAP06454 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTMAP06454 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTMAP06454 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTMAP06454 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTMAP06454 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTMAP06454 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTMAP06454 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTMAP06454 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTMAP06454 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTMAP06454 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTMAP06454 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTMAP06454 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTMAP06454 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTMAP06454 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTMAP06454 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTMAP06454 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTMAP06454 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTMAP06454 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTMAP06454 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTMAP06454 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTMAP06454 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTMAP06454 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTMAP06454 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTMAP06454 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTMAP06454 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTMAP06454 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTMAP06454 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTMAP06454 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTMAP06454 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTMAP06454 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTMAP06454 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTMAP06454 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTMAP06454 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTMAP06454 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTMAP06454 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTMAP06454 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTMAP06454 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTMAP06454 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTMAP06454 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTMAP06454 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTMAP06454 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTMAP06454 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTMAP06454 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTMAP06454 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTMAP06454 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTMAP06454 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTMAP06454 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTMAP06454 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTMAP06454 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTMAP06454 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTMAP06454 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTMAP06454 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTMAP06454 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTMAP06454 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTMAP06454 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTMAP06454 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTMAP06454 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTMAP06454 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTMAP06454 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTMAP06454 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTMAP06454 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTMAP06454 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTMAP06454 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTMAP06454 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTMAP06454 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTMAP06454 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PTMAP06454 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTMAP06454 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTMAP06454 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTMAP06454 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTMAP06454 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTMAP06454 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTMAP06454 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTMAP06454 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTMAP06454 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTMAP06454 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTMAP06454 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTMAP06454 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTMAP06454 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTMAP06454 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTMAP06454 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTMAP06454 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTMAP06454 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTMAP06454 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PTMAP06454 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTMAP06454 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTMAP06454 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTMAP06454 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTMAP06454 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTMAP06454 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms