Protein–RNA interactions for Protein: O96011

PEX11B, Peroxisomal membrane protein 11B, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX11BO96011 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX11BO96011 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms