Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POP4O95707 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POP4O95707 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POP4O95707 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POP4O95707 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POP4O95707 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
POP4O95707 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POP4O95707 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POP4O95707 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POP4O95707 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POP4O95707 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POP4O95707 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POP4O95707 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POP4O95707 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POP4O95707 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
POP4O95707 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POP4O95707 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POP4O95707 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
POP4O95707 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POP4O95707 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POP4O95707 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POP4O95707 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POP4O95707 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POP4O95707 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POP4O95707 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POP4O95707 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POP4O95707 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POP4O95707 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POP4O95707 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POP4O95707 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POP4O95707 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POP4O95707 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POP4O95707 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POP4O95707 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POP4O95707 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
POP4O95707 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POP4O95707 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POP4O95707 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POP4O95707 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POP4O95707 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POP4O95707 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
POP4O95707 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POP4O95707 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
POP4O95707 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POP4O95707 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POP4O95707 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POP4O95707 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POP4O95707 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POP4O95707 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POP4O95707 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POP4O95707 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POP4O95707 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POP4O95707 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POP4O95707 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POP4O95707 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POP4O95707 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POP4O95707 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POP4O95707 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POP4O95707 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POP4O95707 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POP4O95707 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POP4O95707 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POP4O95707 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POP4O95707 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POP4O95707 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POP4O95707 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POP4O95707 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POP4O95707 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POP4O95707 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POP4O95707 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POP4O95707 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POP4O95707 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POP4O95707 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POP4O95707 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POP4O95707 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POP4O95707 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POP4O95707 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POP4O95707 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POP4O95707 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POP4O95707 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POP4O95707 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POP4O95707 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POP4O95707 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POP4O95707 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POP4O95707 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POP4O95707 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POP4O95707 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POP4O95707 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POP4O95707 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POP4O95707 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POP4O95707 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POP4O95707 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POP4O95707 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POP4O95707 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
POP4O95707 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
POP4O95707 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
POP4O95707 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POP4O95707 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
POP4O95707 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
POP4O95707 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms