Protein–RNA interactions for Protein: O95260

ATE1, Arginyl-tRNA--protein transferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1O95260 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATE1O95260 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATE1O95260 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATE1O95260 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATE1O95260 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ATE1O95260 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATE1O95260 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ATE1O95260 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATE1O95260 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATE1O95260 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATE1O95260 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATE1O95260 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATE1O95260 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATE1O95260 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATE1O95260 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATE1O95260 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ATE1O95260 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATE1O95260 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATE1O95260 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATE1O95260 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATE1O95260 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATE1O95260 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATE1O95260 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATE1O95260 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATE1O95260 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATE1O95260 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATE1O95260 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATE1O95260 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATE1O95260 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATE1O95260 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ATE1O95260 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATE1O95260 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ATE1O95260 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ATE1O95260 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATE1O95260 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATE1O95260 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATE1O95260 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATE1O95260 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATE1O95260 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ATE1O95260 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATE1O95260 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ATE1O95260 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ATE1O95260 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATE1O95260 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATE1O95260 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATE1O95260 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATE1O95260 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATE1O95260 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATE1O95260 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATE1O95260 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATE1O95260 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATE1O95260 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATE1O95260 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATE1O95260 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATE1O95260 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ATE1O95260 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATE1O95260 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATE1O95260 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATE1O95260 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATE1O95260 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ATE1O95260 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATE1O95260 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATE1O95260 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATE1O95260 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATE1O95260 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATE1O95260 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATE1O95260 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATE1O95260 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ATE1O95260 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATE1O95260 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATE1O95260 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ATE1O95260 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATE1O95260 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATE1O95260 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATE1O95260 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATE1O95260 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATE1O95260 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATE1O95260 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ATE1O95260 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATE1O95260 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATE1O95260 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATE1O95260 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATE1O95260 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATE1O95260 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATE1O95260 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATE1O95260 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATE1O95260 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATE1O95260 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATE1O95260 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATE1O95260 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATE1O95260 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATE1O95260 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATE1O95260 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ATE1O95260 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATE1O95260 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATE1O95260 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATE1O95260 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATE1O95260 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ATE1O95260 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATE1O95260 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms