Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTNSO60931 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTNSO60931 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTNSO60931 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTNSO60931 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTNSO60931 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNSO60931 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNSO60931 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNSO60931 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNSO60931 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNSO60931 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNSO60931 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNSO60931 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNSO60931 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNSO60931 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNSO60931 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNSO60931 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNSO60931 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNSO60931 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNSO60931 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNSO60931 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNSO60931 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNSO60931 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNSO60931 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNSO60931 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNSO60931 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNSO60931 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNSO60931 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNSO60931 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNSO60931 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNSO60931 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNSO60931 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNSO60931 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNSO60931 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNSO60931 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNSO60931 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNSO60931 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNSO60931 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNSO60931 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNSO60931 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTNSO60931 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTNSO60931 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTNSO60931 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTNSO60931 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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CTNSO60931 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTNSO60931 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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CTNSO60931 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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CTNSO60931 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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CTNSO60931 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTNSO60931 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTNSO60931 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTNSO60931 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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