Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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