Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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APOC4-APOC2K7ER74 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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APOC4-APOC2K7ER74 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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APOC4-APOC2K7ER74 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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APOC4-APOC2K7ER74 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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APOC4-APOC2K7ER74 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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APOC4-APOC2K7ER74 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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APOC4-APOC2K7ER74 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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