Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms