Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms