Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms