Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms