Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 267.5 ms