Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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FOXD3Q9UJU5 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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FOXD3Q9UJU5 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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FOXD3Q9UJU5 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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FOXD3Q9UJU5 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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FOXD3Q9UJU5 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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FOXD3Q9UJU5 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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FOXD3Q9UJU5 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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FOXD3Q9UJU5 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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FOXD3Q9UJU5 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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FOXD3Q9UJU5 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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FOXD3Q9UJU5 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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FOXD3Q9UJU5 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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