Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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RABGEF1Q9UJ41 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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RABGEF1Q9UJ41 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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RABGEF1Q9UJ41 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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RABGEF1Q9UJ41 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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RABGEF1Q9UJ41 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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RABGEF1Q9UJ41 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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RABGEF1Q9UJ41 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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RABGEF1Q9UJ41 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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RABGEF1Q9UJ41 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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RABGEF1Q9UJ41 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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