Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NYXQ9GZU5 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms