Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms