Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS1

KRTAP1-5, Keratin-associated protein 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-5Q9BYS1 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP1-5Q9BYS1 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms