Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms