Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms