Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMNQ96JQ2 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms