Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00526Q96FQ7 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.2 ms