Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms