Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCOLN3Q8TDD5 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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