Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATL2Q8NHH9 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms