Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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ZNF439Q8NDP4 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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ZNF439Q8NDP4 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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ZNF439Q8NDP4 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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ZNF439Q8NDP4 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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ZNF439Q8NDP4 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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ZNF439Q8NDP4 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ZNF439Q8NDP4 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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