Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CLDN19Q8N6F1 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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CLDN19Q8N6F1 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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CLDN19Q8N6F1 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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CLDN19Q8N6F1 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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CLDN19Q8N6F1 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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CLDN19Q8N6F1 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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CLDN19Q8N6F1 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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