Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWV2

CNTN4, Contactin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN4Q8IWV2 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTN4Q8IWV2 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms